Plugin Bio Research per Claude
Di Anthropic
Cosa fa
Collegati a strumenti e banche dati di ricerca preclinica (ricerca bibliografica, analisi genomica, priorità dei bersagli) per accelerare la R&S nelle scienze della vita.
Comandi
Cosa puoi scrivere in Claude dopo aver aggiunto questo plugin.
/bio-research:instrument-data-to-allotropeConverte i file di output degli strumenti di laboratorio (PDF, CSV, Excel, TXT) nel formato JSON Allotrope Simple Model (ASM) o in CSV 2D appiattito. Usa questa skill quando gli scienziati devono standardizzare i dati degli strumenti per i sistemi LIMS, d…
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/bio-research:nextflow-developmentEsegue pipeline bioinformatiche nf-core (rnaseq, sarek, atacseq) su dati di sequenziamento. Da usare per analizzare dati RNA-seq, WGS/WES o ATAC-seq — sia FASTQ locali sia dataset pubblici da GEO/SRA. Si attiva con nf-core, Nextflo…
/bio-research:scientific-problem-selectionDa usare quando gli scienziati hanno bisogno di aiuto nella scelta dei problemi di ricerca, nell'ideazione dei progetti, nella risoluzione di progetti bloccati o in decisioni scientifiche strategiche. Usa questa skill quando gli utenti chiedono di proporre un nuovo…
/bio-research:scvi-toolsDeep learning per l'analisi di singole cellule con scvi-tools. Da usare quando gli utenti hanno bisogno di (1) integrazione dei dati e correzione dei batch con scVI/scANVI, (2) analisi ATAC-seq con PeakVI, (3) CITE-seq multimodale…
/bio-research:single-cell-rna-qcEsegue il controllo qualità dei dati RNA-seq di singole cellule (file .h5ad o .h5) secondo le best practice scverse, con filtraggio basato su MAD e visualizzazioni complete. Da usare quando gli utenti richiedono un'analisi QC, il filtraggio di cellule di bassa qualità…
/bio-research:startConfigura l'ambiente bio-research ed esplora gli strumenti disponibili. Da usare quando ci si orienta per la prima volta con il plugin, si verifica quali server MCP di letteratura, drug discovery o visualizzazione sono connessi, o si esaminano gli…
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